در بازی Captain Sonar بازیکنان در نقش کاپیتانها و خدمهی دو زیردریایی هستند که قصد دارند با حمله به یکدیگر، دیگری را نابود کنند. در هر زیردریایی هر بازیکن یک نقش دارد. این نقشها شامل کاپیتان، معاون، مهندس و متصدی رادیویی میشود. هر کدام از این نقشها یک توانایی ویژه داشته و هر کدام میتوانند نقش مهمی در جریان بازی داشته باشند. بازی تا جایی پیش میرود که یک گروه بتواند محل دقیق زیردریایی حریف را شناسایی کرده و دستور حمله دهد. اگر شلیک موفق باشد آن تیم پیروز بازیست و اگر ناموفق باشد بازی ادامه پیدا میکند. در این بازی نقشه های مختلفی وجود دارد که میتوان به وسیلهی آنها بازی را سختتر و یا آسانتر کرد.